こればっかりは、完全に頭の中で行うしかありません。
現実には黙って頭の中だけで実行するのは難しいので、「フンフンフンッ」とか口ずさみつつ、
歌詞に合わせて鼻歌の続きを付けてゆきます。
大人になった今では、本は黙読するのがあたりまえかもしれませんが、読みの基本は「音読」です。
小学校の頃は教科書だって音読してたでしょ。
歌も当然、「歌う」のが基本なんです。
これも周囲から見ればアホに見えるのですが、気にしてはいけません。
「フン、フン、フンッ」です。
そうして、主旋律だけは歌えるまでに仕上げてください。

残念ながら、この音を付ける段階には、うまい方法や奥義はないみたいです。
もしあるとすれば、

　　「繰り返し＋変形」

でしょうか。
いまの段階だと、少なくとも「鼻歌フレーズ」だけはできているかと思います。
その鼻歌フレーズを、まずは単純に繰り返してみます。
そのままだとつまらないので、
　・後ろの方を上げてみる
といったことをしてみると、だんだん盛り上がって後に続く感じになります。
これを２番目くらい、起承転結の「承」のあたりにもってきましょう。
反対に、
　・後ろの方を下げてみる
といった変形ができれば、これは最後に終わった、って感じがするので、最後の「結」の部分とかに使えます。
次に来る「転」の部分は難しいのですが、
　・もし長調の歌だったら、ここでちょっと短調っぽく歌ってみる
　・同じ節回しを、２音くらい高い音で歌ってみる。合唱で言えば「高音パート」といった感じ。
　・同じ節回しを、２音くらい低い音で歌ってみる。合唱で言えば「低音パート」といった感じ。
最後の「結」の部分には、とりあえず最初の「起」の部分をもってきます。
うまくすれば、先の「後ろの方を上げてみる」「下げてみる」といった変形があてはまるかもしれません。

要は「基本フレーズの変形パターン」さえ作ることができれば、
あとは「繰り返し＋変形」を並べることによって、全体を作ることができます。
変形には基本定石みたいなものがあって、

　　・後ろの方を上げてみる
　　・後ろの方を下げてみる
　　・長調 ←→ 短調を変えてみる
　　・２音くらい高い音の「高音パート」
　　・２音くらい低い音の「低音パート」

最低限これだけで何とかなります。
繰り返しといっても「起承転結」であれば４回、そのうち「起」と「結」を同じにすれば、
実際に変形が必要なのは「承」と「転」の２カ所だけです。

具体的な変形がどんなものか、「ミクは牛乳　好きだから」の１フレーズで試してみましょう。

ええと、必ずしも説明通りではないのですが、そのへんはフィーリング優先ってことで。
理屈通りには行かないですね。
要は基本フレーズを変形して、それらしくあてはめてみる、ということなんです。